Не совсем уверен, потому что кода не хватает в вопросе. Но симптом звучит как "если шаблон определяется не в том же файле, где он объявляется, то ничего не работает". Это частая ошибка на С++ с шаблонами.
Когда компилятор видит, что шаблон используется, он генерирует код с конкретной спецификацией шаблона. Но делает он это только в текущем юните трансляции. Так что если у вас шаблон определен в другом cpp файле, то компилятор эти определения не видит и не может сгенерировать их спецификацию, когда обрабатывает cpp с использованием шаблона. А когда дело доходит до cpp с шаблоном, то компилятор не видит, где и как шаблон используется и тоже не генерирует никакой спецификации.
Поэтому надо или шаблон объявлять и опеределять в хедере, чтобы оперделения были везде, или в cpp с определениями указать спецификацию для всех используемых варинтов шаблона. Вроде
using my_template<int>;
