Ищешь какие ножки на nodemcu v3 являются уартом для прошивки, подключаешь к ним ардуину с заземлённым ресетом (чтобы ардуина молчала).
Ком порт который появится в винде, будет компортом для прошивки nodemcu, далее прошиваешь как обычно.
Возможно надо будет нажать кнопку для прошивки на nodemcu.
Вот недавно был вопрос
Проблема с ESP8266 (ESP-12F)?
Сделай по аналогии, только правильно подключи.