1/ из описания - чем угодно скопировать недостающие (!) файлы из OLD в рабочую
2! в дальнейшем для резервного копирования и т.д. ЛОКАЛЬНО использовать проверенное ПО с сохранением версий документов и т.д. каждые X часов в рабочее время, а в непонятные "облака" отправлять зашифрованный архив ночью в нерабочее время