У вас ноут или настольный? В настольном выходов звука может быть несколько (например, втычки 3,5 мм на фасаде и на тыловой панели), и переключением между ними идёт программно, под управлением драйвера, в зависимости от того, какая втычка задействована.
В ноутах ввиду единственности втычки чаще всего применяется механическое переключение, и в качестве переключателя выступает сама втычка, представляющая собой не только ответную часть разъёма, но и две группы контактов на переключение. Если разъём не вставлен, то звуковой ток от усилителя идёт на встроенные динамики, а если вставлен, то эти контакты отключают встроенные динамики и подключают выход усилителя на этот разъём.
Отсюда вывод - у вас что-то случилось с этими переключающими контактами: разъём от внешних колонок они подсоединили, а цепь встроенных динамиков не разомкнули. Такое обычно бывает, когда разъём вставлен не до конца (например, из-за его нестандартной формы или размеров). Ну, посмотрите, что мешает всунуть его глубже, и устраните это. Опробуйте несколько разных разъёмов, и если некоторые из них действуют правильно, сравните с теми, которые действуют неправильно, определите разницу и устраните её.
Ещё одна возможная причина - на ноуте у вас комбинированный 4-контактный разъём (т.е. такой, через который кроме наушников/колонок подключается ещё и микрофон), а вы втыкаете туда обычный 3-контактный штекер. В этом случае нужен переходник.
