Дмитрий

В конце 90х будучи школьником (9-11 класс) я брал у студентов (1-2 курс) и заочников лабораторные и курсовые, и делал их за деньги. Именно программную часть. Оформлением особо не занимался. Выходило нормально )

Вы путаете терминальный доступ и виртуальные машины.

На линуксе вы можете предоставлять терминальный доступ только к линуксу (ssh, VNC). ssh - только консоль, VNC - тормозной, никогда не использовал его для работы пользователей, думаю счастья у них не прибавиться. Хотя в локальной сети, возможно, будет нормально работать.

На гипервизоре под линуксом вы можете поднять любую ОС в качестве ВМ и раздавать доступ к ней. Поднимите нужное количество виндовых ВМ, подключайтесь к ним по RDP.
Сервер с гипервизором не стоит использовать в других целях (SQL, Дело, ...) - просядет производительность и ВМ и других служб.
Кстати: разве "Дело" работает на линуксе? На сколько помню, там исключительно винда, т.к. .Net/IIS/MSSQL.
Ее то же будете поднимать на виртуалке?

Вам было бы удобней поднять на сервере Windows Server в качестве терминального сервера и использовать RDP для подключения клиентов. Но Windows Server стоит денег и лицензии на терминальное подключение то же не бесплатные.
Если сервер достаточно мощный, а одновременно работающих клиентов относительно не много и у них "легкие" задачи, то на сервер можно повесить и дополнительный функционал.

Если будете покупать железный сервер, то рекомендую сразу же включить в комплект Windows Server и лицензии для терминального подключения. Так бывает проще протащить покупку нужного ПО - вместе с железом без которого обойтись нельзя.

На счет проброса USB портов с ключами шифрования - могут быть проблемы. Только вариант с Windows Server + RDP + локальный USB порт сервера для ключей дадут гарантию работоспособности. Но часто по разным причинам невозможно использовать порты сервера. Нужно сначала тестировать ту конфигурацию, на которой вы остановитесь.

Как такового общего нет в принципе, от версии к версии он довольно сильно меняется. Но для възда в тему:
1) Обязательно стоит начать с прочтения "Asterisk: будущее телефонии", да она устарела но стоит начинать именно с нее т.к. захватите процентов 60-70% всего необходимого. Возможно даже и остановитесь на версиях подходящих под книгу.
2) Документация к каждой версии.

Всякие видокурсы\туториалы это лютая хрень. Прочтите книгу, станет понятна документация а дальше уже ничего и не надо. Если что то будет надо сделать то сядете и сделаете без подсказок.

PS вспомнил еще момент. Ни одна книга и ни один туториал не даст грамотного понимания о всяких связных вещах типа dhcp\dns\tftp\приколах сети и связанного с ними, которые не обязательны но могут быть очень важны, по ним уже любая хорошая книжка по общему устройству unix\linux либо для конкретного диструбутива bsd like\debian\centos-rhel и т.д. . В каждой это отличается в т.ч. тонкости сборки астериска из изходников и особенностей.

Ваш бухгалтер ошибается.
Ваш доход это то - что в итоге упало на счет, то что будет проходить валютный контроль.
Комиссия апворка это их доход и с него они плтатят НДС.

Это кстати отлично отражается в договоре, который заключается при превышении суммы работы по контракту.

Меняйте срочно бухгалтера, понабрали студентов там каких-то

Предлагать однозначно.

есть шанс что вас возьмут не в один проект(я знаю это редкость) и тогда что делать, если время ограничено.

Предложить не значит, что вы уже обязываетесь сделать работу.
Если времени на всех не хватает, то просто отказываетесь и всё. Говорите, что сейчас заняты на другом проекте. Абсолютно нормальная практика для работающих людей.