Правильнее не актуальные зоны бекапить и удалять.
Например, вы развернете у регистратора какой-то сервис, по умолчанию он будет использовать DNS регистратора, в котором лежит не актуальная зона DNS и вашему сервису будут отдаваться не актуальные данные.
Все виды DNS записей делаются в актуальном месторасположении DNS зоны, то есть там, куда смотрят текущие NS серверы.