На запись должна быть одна база. На чтение можете сделать репликацию.
Соответстенно по этой схеме каждый сервис, который может работать относительно самостоятельно.
У новостного сайта например могут быть:
- Пользователи
- Статьи
- Комментарии
- Баннеры
Любой из этих списков может быть разделён на дополнительные сервисы, чтение/запись.
Итого, вы должны максимально безболезненно пережить отказ мастер сервера (запись) любого из модулей.