Дмитрий

Читаете файл построчно в цикле, по условию проверяете строку на соответствие метке, если совпадает - выполняете запись в новый файл:

$export = 'export.txt';
$import = 'import.txt';

$exp = fopen($export, 'r');
$imp = fopen($import, 'a');

$switch = false;

while ($line = fgets($exp)) {
    $line = trim($line);
    $line != '@export_end@' ?: $switch = false;
    ! $switch ?: fputs($imp, $line . PHP_EOL);
    $line != '@export_start@' ?: $switch = true;
}

fclose($exp);
fclose($imp);

"Ошибка 500" фиксируется в логах, читайте их, чтобы узнать в чём конкретно дело.
Может, у вас памяти не хватает скрипту, а может где-то поле created_at не заполнено - может быть что угодно.

Класс 'mysqli' не найден. Установите пакет php-mysql.
https://www.php.net/manual/ru/mysqli.installation.php

Первый пришедший в голову вариант:

SELECT user_id
FROM some_table 
WHERE num IN (878, 925, 242)
GROUP BY user_id
HAVING COUNT(DISTINCT num) = 3 -- 3 количество вариантов
;

MySQL fiddle

Вариант с JOIN:

SELECT some_table.user_id
FROM some_table 
JOIN some_table st1 ON st1.user_id = some_table.user_id AND st1.num = 925
JOIN some_table st2 ON st2.user_id = some_table.user_id AND st2.num = 242
WHERE some_table.num = 878
;

MariaDB fiddle

Вариант с GROUP_CONCAT (номера должны быть отсортированы):

SELECT user_id, GROUP_CONCAT(DISTINCT num ORDER BY num)
FROM some_table 
WHERE num IN (878,925,242)
GROUP BY user_id
HAVING GROUP_CONCAT(DISTINCT num) = '242,878,925'
;

MySQL 8.0 Fiddle

https://www.unphp.net/decode/7dff0f34d1a66d8ba109c...

Доменное имя содержит нелатинский символ, соответственно это IDN, в латинице представляемый в виде punycode.

Технически это возможно.
На практике так не делают, потому что код должен соответствовать стандартам PSR. Одно из явных упоминаний есть в PSR-1, пункт 3.
https://www.php-fig.org/psr/psr-1/

Все дело в том что utf8mb4_unicode_ci использует 4 байта для кодирования одного символа, плюс 1 байт хранит длину строки. Соответственно (255+1)*4 = 1024.
Уменьшит размер данных можно, и даже нужно, с учетом что текущие данные не будут повреждены. Проверить максимальную длину строки:
SELECT MAX(fieldname) FROM table;

Выбор размера данных зависит от их возможных значений. Например если поле может быть только "да", "нет" , "иногда" то достаточно varchar(6)

Кроме того если строковое поле имеет ограниченный набор значений имеет смысл использовать enum или отдельную таблицу со словарем

navicat, dbforge, mysql workbench и ещё 100500 других.
проще самому поискать и перебрать - хотелки и вкусы у всех разные.
или хотя бы обозначить интересующие субд.

Да куча их.
Для сиквела management studio

Потому что любой конструктор ограничен тем набором блоков, которые он предоставляет. Грубо говоря, невозможно собрать из Лего штопор даже если блоки будут стальными: форма не позволит. Так что как только вам нужно сделать что-то не укладывающееся в стандарт конструктора, тут же приходится что-то учить.