Сергей

Вынесу ответ из коментов сюда. чтобы сразу видно было.

Большое спасибо Сергей! Он правильно подсказал.

"SEF_FOLDER" => "/storages", замените на "SEF_FOLDER" => "/storages/",
В битриксе необходмио указывать слеш на конце для папок
Соответственно
"SEF_URL_TEMPLATES" => array(
"liststores" => "",
"element" => "#store_id#/",
)

php.net/manual/ru

Если template.php это шаблон компонента, то создайте в этой же папке рядом с template.php файл script.js, а в него закиньте скрипт. Он автоматически подгрузится при подключении компонента. Тут можно почитать про шаблоны компонентов.

Если же вы под template.php имеете ввиду шаблон сайта: header.php или footer.php, то можно использовать

$APPLICATION->AddHeadString('
<script>
//some script
</script>
');

CIBlockElement::GetList - документация по функции, там все есть.

Если Вам требуется получить поля элементов инфоблока (без свойств), можно использовать getList нового ядра.
ElementTable - класс для работы с таблицей элементов инфоблоков.

нет только так надо

<td>
				<table>
					<tr>
						<td>2</td>
						<td>2</td>
						<td>2</td>
						<td>2</td>
					</tr>
					<tr>
						<td>2</td>
						<td>2</td>
						<td>2</td>
						<td>2</td>
					</tr>
				</table>
				</td>