Saboteur

Например, потому что могут быть методы, которые вызываются только внутри этого класса. И очень полезно, чтобы снаружи они были недоступны.

Если создаешь Public методы - это означает что кто-то может его использовать. И в случае крупного продукта - это может быть другой программист, а может даже другая программа. И если в будущем захочешь модернизировать, то со всеми public методами нужно думать про версионирование и legacy саппорт.

Можно.

Структуры данных нужно учить в каком-то языке программирования.

Собственно вся суть в том, что кроме чисел и строк есть массивы, ассоциативные массивы, кортежи, собственные структуры, готовые объекты и так далее.

Под капотом это все равно биты и байты, но нужно просто немного набить руку, чтобы не путаться, поскольку в век быстрой разработки нужно уметь пользоваться готовыми инструментами, прежде чем изобретать свой велосипед.

Основное чему нужно научиться - самоорганизации.
Уметь не лениться и ждать пока кто-то принесет самую лучшую книгу или подскажет самый лучший курс. Гуглить незнакомые термины.

Ставить самому себе задачи, которые понятны вам и реализовывать их при помощи программирования - именно собственная задача, когда вы заранее представляете себе какой результат вы хотите получить, позволит вам самостоятельно писать программы, которые этот результат выдают, а не писать примеры из учебников, которые выдают "какой-то там результат и хрен его знает как он получается, но вроде работает".

Начните с html/css/javascript и питон, потом добавите sql.
И не что-то из этого, а все вместе.

1. Путь начинающийся с C: не должен работать в git-bash, так как в линуксе в пути не должно быть двоеточий.

2. По вашему вопросу - git-bash монтирует /usr/local/bin и другие папки, потому что в POSIC есть принятый стандарт для дерева каталогов, И git-bash его имитирует.

3. Ссылка не есть гуд. Работа с библиотеками в windows устроена не так, как в windows, поэтому делать ссылку на бинарник - означает что он будет запускаться не из своей директории, где есть еще и другие ресурсы, а из директории с ссылкой. Может быть ошибка.

4. Гораздо лучше добавить в PATH директорию с subline, например так:
PATH=$PATH:"e:/SublimeText3/"
и можно вызывать sublime

Это не короткие пути. Это просто названия конкретных исполняемых файлов.
Так же как и dota2.exe, где-то лежит regedit.exe или printui.exe

В системных настройках есть переменная PATH, в которой перечислены директории, в которых могут лежать такие файлы, и следовательно при попытке выполнить lalala, Windows попробует найти во всех директориях, перечисленных в PATH файлы lalala.exe, lalala.com, lalala.bat, lalala.cmd, и только затем выдаст ошибку, если не найдет.

Другими словами, если вы установили dota2 в c:\games\dota, и исполняемый файл у вас c:\games\dota\dota2.exe, то вам нужно добавить c:\games\dota в PATH, и появится новая "короткая команда" - dota2

PHP - язык программирования.
PHP может генерировать просто текст. То, что при помощи PHP вы можете генерировать именно HTML страницы - это уже частный случай (правда это и есть самое популярное использования PHP). Но при желании, вы можете генерировать HTML страницы как угодно, любым языком программирования.

Apache - веб сервер. Один из самых популярных веб-серверов.
Для связки PHP И Apache, у Apache есть специальная библиотека, которая позволяет прямо из веб-сервера вызывать выполнение PHP кода для генерации страниц.

80-й порт - это стандартный порт для HTTP протокола.
Чтобы обмениваться данными, две программы должны знать адрес друг друга.

IP адреса недостаточно, потому что на компьютере у вас может висеть скайп, аська, браузер, какая-нить игрушка - и если пришел пакет данных по сети, как операционная система должна понять в какую программу эти данные передать? Для этого к IP адресу добавляется "порт".
При указании URL в браузере, вы обычно не указываете порт, потому что для HTTP подразумевается 80 порт по умолчанию, для HTTPS 443 порт по умолчанию. Но можно указывать и так:
http://google.com:80

P.S. На самом деле, достаточно посидеть на википедии, чтобы выяснить значение уже известных вам терминов.