Надо знать собственно как грузится и работает система.
Права доступа, bash, iptables, LVM, работа с репозиториями конкретного дистрибутива.
Читайте «Unix и Linux. Руководство системного администратора»
Авторы: Эви Немет, Гарт Снайдер, Трент Р. Хейн, Бэн Уэйли
Стандартного "стека" для Линукса походу нет, ибо в серверной среде Линукс весьма многообразен.
На нем стоят веб-сервера, базы данных, различные инструменты разработчиков и инструменты для CI, сервера приложений, виртуальные машины, контейнеры...
Ну и можно ориентироваться на
www.lpi.org
И да, оно рядом, но не нужно путать Линукс и фряху.