С чем это связано?
С тем, что в режиме сцены вы видите так, как сами настроите, а в режиме игры - строго через камеру. Настройки камеры и вьюпорта редактора сцены естественно могут отличаться - от типа проекции до позиции.
И еще такой вопросик, подскажите альтернативу Linerendrer, главная задача нарисовать график
Использовать не игровой движок, а что то более приспособленое для рисования графиков. Тот же Excel.