Не важно какую ОС вы выберите - принципы сетевого взаимодействия не зависят от ОС, в RFC вы не найдете упоминаний про линукс или бсд. Поэтому вы на любой ОС можете настроить все что угодно для работы в сети. К тому же многое из сетевого ПО портировано под разные ОС, соответственно и настраивается одинаково.
Например фаервол pf, который начался с OpenBSD портирован во FreeBSD (pfSence на нем построен), так же есть и на линуксе и т.д.
Важнее понимание принципов работы сети, а не конкретной реализации.
Именно понимание принципов (теории) даст осознанность действий.
Берите ту ОС с которой вы непосредственно работаете и навыки в которой вы можете применить в жизни вот прям сейчас. Нет идеальной ОС, они все могут делать примерно одно и то же (с разной эффективностью, но эффективность часто зависит от кривизны рук) и даже винда. Полученный опыт на одной ОС легко переносится на любую другую, т.к. принципы работы сети везде одинаковы.