По сути это полуручная работа.
Нужно все таблицы привести к единому виду, а потом загрузить.
Либо сделать скрипт для загрузки 1 файла, что удалось перенести переносим скриптом, остальное руками.
Нужно было думать до того как раздавали форму заполнять.
Как вариант - подготовить универсальную форму и, включив административный ресурс, спустить ее с требованием все привести к общему виду. Форму лучше защитить паролем, оставив для редактирования только нужные ячейки, где можно добавить выбор из возможных вариантов и прочую проверку ввода.