mvsavkin

Использовать классы из пакета java.io или java.nio.

это отменит последний коммит, но оставит изменения
git reset --soft HEAD~1

а это -- дополнит текущий коммит обновленными данными.
git commit --amend

очень важно НЕ делать эти манипуляции если отменяемый коммит уже был залит на сервер и скачан коллегами.

Главное преимущество и проклятие скриптовых языков - их динамическая природа. С одной стороны это даёт быстрый цикл разработки, а с другой утяжеляет поддержку крупных проектов. В строготипизорванной Java большая часть ошибок, особенно глупых, уходит на этапе компиляции. С другой стороны, чтобы запустить простой проект на Java придётся выполнить много лишних телодвижений. Ну и всем известная смешная картинка


Поэтому лучше выбирать инструмент под задачу, не забивать кувалдой шпильки и не стучать ювелирным молоточком по железнодорожному костылю.

Чтобы решить проблемы, которые у вас существуют, нужно сделать 3 вещи, но планомерно и плавно.
1. Обучите программистов такой вещи, как git. Подождите с недельку. Затем просто прогоните их по циклу - откати эти изменения. Верните изменения. Ну раз 5, с дедлайном вчера. Все, кто не будет пользоваться git, будут мучаться часами и днями. Напомните им, как легко это делается с помощью git. Повторите испытание через некоторое время. Поставьте ультиматум: git или идите искать новую работу. Кстати, у каждого человека должен быть свой отдельный аккаунт.
2. Держите репозитарий для проекта целиком. Сделайте отдельные папки для исходников верстки, для собранной верстки и самого сайта. Верстальщики работают со своими папками. Собирают верстку и коммятят собранную верстку в отдельную папку. Программисты через историю коммитов смогут отследить изменения и внести их назад в разработанные компоненты.
3. Реализуйте автоматизированное развертывание проекта и запретите редактирование файлов через FTP/минуя git.

Ну а в целом ваша проблема - низкая квалификация кадров. Решается просмотром ютуба и обучением разработчиков. Если кто-то не хочет учиться, немного снижается ставка, а деньги отдаются тем, кто учится. Даже 500 рублей будут отличным мотиватором.

www.syntevo.com/smartgit

ну слушай, если деплоишься в Payara, что тебе мешает использовать payara micro?

import fish.payara.micro.BootstrapException;
import fish.payara.micro.PayaraMicro;

public class EmbeddedPayara 
{ 
    public static void main(String[] args) throws BootstrapException
    {   
        PayaraMicro.bootstrap();
    }    
}

и запускаешь прямо с кнопки Play в Idea
вот документация