ПК всегда лучше:
- по цене (при одинаковой производительности),
- по производительности (при одинаковой цене),
- по размеру монитора,
- по свободе (комфорту) расположения клавиатуры и монитора,
- по возможности апгрейда.

Ноут лучше только в том, что его можно брать с собой и в том, что некоторое время можно работать без розетки.

Что перевесит в вашем случае - решать вам.

Ничего волшебного в них нет. ИК излучение это не рентген. Нагревает только видимую поверхность. Пощупай технику, за которую беспокоишься и примерно поймёшь даже без градусника. Если она нагревается не выше чем ~40 в выключенном и ~50 во включеном состоянии, то всё нормально. Точнее можно покопать данные по допустимым температурам в документации к самой технике. Опасней всего, наверное, экранам мониторов - на их экран ИК напрямую воздействует. Но в целом, думаю, большой угрозы не должно быть. Если человек не ловит теплового удара, то и техника должна.

Недавно обзор был: https://habr.com/ru/articles/757306/

Электронные чернила всё же часто лучше. Ну а по удобству личтания туда-сюда с бумажной книгой мало что сравнится может.

Слишком общий вопрос. Любая инженерная программа моделирует физические процессы.
В одних рассчитывают прочность и устойчивость строительных конструкций. В других моделируют деформации автомобилей при авариях. В третьих моделируют течение воды в самых разных условиях. Они все готовы на уровне "купи и пользуйся".
Если хочешь делать своё, то надо отлично знать 3 вещи: физику, математику, программирование. Простенькие задачи на уровне движения точек или столкновения шариков написать не проблема. Если моделировать упругие сложные тела, то задача становится тем сложнее, чем ближе к реальности хочешь получить решение.