когда создаю запрос, который обращается к данным табличной части, он не может найти мою табличную часть то есть "не удалось найти таблицу и указывает на кусок кода с "ИЗ Обработка.Связь.Таблица". Как только путь к таблице не указывал уже.
Дело в том, что запрос обращается к базе данных. Обработки не имеют таблиц в БД и ничего там не хранят., во-вторых вы эту таблицу заполняете интерактивно, даже, если бы у вас была табличная часть документа, или справочника, то все изменения, которые вы внесли в открытой форме были бы еще не записаны в БД.
Собственно, что можно сделать: запросом получать данные из таблицы значений, которая передается параметром.
Код будет вида
Запрос.Текст = "Выбрать ...бла-бла-бла... Из &ТаблицаЗначений;"
Запрос.УстановитьПараметр("ТаблицаЗначений", Объект.МояТабличнаяЧасть.Выгрузить());
А вообще, если вам нужна только пара документов, то запрос не нужен - ссылки уже находятся в таблице и достаточно ее обойти в цикле.