Так сделать невозможно.
Запрошенный (короткий) путь вы можете увидеть в
$_SERVER['REQUEST_URI']
, а фактическое место из которого запустился скрипт
$_SERVER['DOCUMENT_ROOT']
$_SERVER['SCRIPT_FILENAME']
$_SERVER['SCRIPT_NAME']
изменить нельзя, так как эти значения определяются в момент запуска.
Хотя можете попробовать один "финт ушами" это указание
auto_prepend_file
в .htaccess
делаете некий скрипт
prepend.php
который будет автоматически загружаться при запуске любого скрипта и в нём перезатирайте что хотите.
php_value auto_prepend_file /www/server/prepend.php
p.s. как уже написали ранее - всё это попахивает каким-то извращением и я не знаю ни одного случая когда мне в моих скриптах надо было бы делать что-то подобное.