Насколько мне известно зарядка литиевых аккумуляторов происходит в 3 этапа, а именно:
1. Основной этап, на котором аккумулятор заряжается током, составляющим ~ 0,4…1 от его номинальной емкости. За время основного этапа аккумулятор набирает порядка 70-80% от своей рабочей емкости.
Кстати, именно длительность основного этапа заряда указывается в документации на телефон, а по его окончанию телефон сообщает о завершении зарядки;
2. Доводочный этап, на котором аккумулятор добирает до своей полной емкости. Формально, данный этап является необязательным, но именно благодаря нему, аккумулятор может добирать до 20-30% от своей емкости, соответственно, пропорционально увеличивается время автономной работы устройства. Величина тока заряда на этом этапе постепенно снижается, а полным окончанием зарядки считается момент, когда величина зарядного тока составит достаточно малую величину от своего начального значения.
3. Этап компенсационного заряда. В случае если после полного окончания заряда аккумулятора телефон не был отключен от зарядного устройства, с некоторой периодичностью, производится его подзарядка небольшим током, для компенсации возникающего разряда.
Это значит, особого вреда, от держания телефона на зарядке нет.
Кстати, несмотря на то, что у литиевых аккумуляторов эффект памяти практически отсутствует, для получения максимального времени автономной работы рекомендуется периодически выполнять полные циклы заряд-разряда – полностью разряжать (от отключения телефона с сообщением «Батарея разряжена») и полностью заряжать аккумулятор.