Вам в любом случае придется "вручную" сканировать маркировку с конкретных экземпляров товаров, которые вы отгружаете клиенту, так как они уникальные на каждом товаре. Для работы в офлайн-магазине подойдет любая модель фискального регистратора, которая подключается к 1с. Самые распространенные производства Штрих и Атол.
И вы не написали какая сейчас касса используется и как - облачная или в магазине.
В качестве сервиса который все это обслуживает, можно рассмотреть Комтет Касса. Он может работать с Битриксом, 1с и Юкассой (хотя возможно сейчас вы его и используете).