А я не согласен с двумя предыдущими коллегами. Не такой уж и большой объем данных гоняется между сервером 1С и БД, чтобы сеть стала причиной тормозов. Разумеется если сеть не 100 мбит и нормально функцинирует. А вот удобство администрирования гораздо выше с двумя серверами.
По поводу самого вопроса, выше тоже ответили: берите тот, с чем уверенно сможете разобраться в случае каких-либо проблем. Так как 99,9% все будет на Windows, то если не важен проброс USB, то я бы в продакшене использовал Hyper-V. Хотя бы исключительно из-за цены.