Если у Вас есть всего одна железяка, на которой нужно разместить 3-4 базы 1С и до 30 пользователей в RDP, то не вижу смысла разносить скуль и 1С. Экономия на использовании Shared Memory небольшая, но она есть, зато будет экономия на целой виртуальной машине, которую не придется держать в онлайне, а ресурсы никогда лишними не будут. Запасную виртуалку с отдельным сервером 1С можно держать выключенной и использовать только при переходе на новую платформу для тестирования.
Насчет платформы до меня все сказали - гипервизор любой, который Вам быстрее и проще поднять и поддерживать. Проброс USB в крайнем случае решается отдельным софтом, ломаным или недорогим.