Можно.
Простейший вариант - читайте справку про аргументы командной строки, многим командам можно все необходимые данные передаьт при запуске.
Далее читайте про про перенаправления.Например, для подобной команды, как
$ command
press "yes" to continue
(вводим yes)
completed
$
В скрипте для автоматизации можно сделать
command <<<"yes"
command <<EOF
yes
EOF
echo yes > answers.txt
command <answers.txt