АртемЪ

Реально ли на сегодняшний день восстановить данные с жёсткого диска?

Во многих случаях реально.
Но без гарантии.
Т.е это дорого, долго, и без гарантии.
Да еще и специалиста трудно найти - берутся за восстановления все.
Только из них 2% реальные специалисты, а остальные 98% взяв диск на восстановление, идут на тостер и спрашивают как же его восстановить.

Чем исправить bad sectors

Они не исправляются.
Если сектор битый - диск его переназначает, сам, без всяких утилит.

Никаких утилит для этого нет и быть не может.

Все эти графики ничего полезного не говорят.
Очередь диска надо смотреть.
iostat
atop
С большой вероятностью он просто не справляется с нагрузкой.

Маловероятно
Контроллеры как правило дешевые и дохнут как мухи.
Диск дохнет от ударов если это HDD.

1. Как правило в винде она определяется как внешний накопитель на стандартных драйверах, диск не нужен. Если диск на 3.5 дюйма то потребуется блок питания 12вольт для питания двигателя диска.
   
2. Почему бы нет.
   
3. Непонятен вопрос - вы что систему на внешний диск ставить собрались?
   
4. Учитесь рисовать.
   

Если системы разные, у них разные ОС - и они просто не будут монтировать неизвестные разделы.
Если системы одинаковые - запретить в самих ОС монтировать диски.

Процесс идет, но статистика использования диска по df -h не меняется. Подскажите в чем может быть проблема?

А проблема то какая? Не вижу проблемы.
Вы же сами говорите - процесс идет.
Вот когда процесс будет закончен смотрите статистику.

Нет такого понятия как просыпается. Запускается он около секунды.
Просто у вас видимо отложенный запуск в биосе стоит - второй диск включается на минуту позже

Да, если цена устраивает, и гарантия есть.
При нормальном хранении там особо нечему портиться за такой срок.
Просто как правило новые диски подешевле при такой же емкости.

1. Если с диском проблемы его выкидывают.
   
2. Если на диске ценная информация - восстанавливают информацию из бэкапа.
   
3. Если бэкапа нет - диск берегут как зеницу ока, не включают, и отдают специалистам по восстановлению.
   
4. Если на диске информация ненужная, но есть желание поэкспериментировать - экспериментируют пока диск не рассыпется окончательно.
   

Если я правильно понял ситуацию, то для этого нужно запретить отключение питания для экономии энергии на USB.
Диспетчер устройств- Контроллеры USB- USB концентратор - управление питанием.

Надо смотреть что SMART пишет, а вообще-

diskpart
list disk ищите номер нужного диска
sel disk выбираете нужный диск
clean
После чего инициализировать и запустить форматирование без галки "быстрое"
Если пройдет нормально - с диском все в порядке
Если нет - менять надо.

Почему может уменьшаться скорость передачи?

Ну у вас там три явных причины может быть для этого.
1)Снижение скорости считывания на HDD с которого копируете.
2)Сеть.
3)Снижение скорости записи на HDD куда копируете.

Сеть - маловероятно, но в принципе при большой загрузке канала возможна.
Наиболее вероятен первый пункт.
Скорость чтения с диска зависит от того где расположены данные и что это за данные.
Для обычного среднестатистического HDD -
Если читается большой нефрагментированный файл - скорость будет порядка 150мб/с в начале диска и около 100мб/с в конце диска.
Если читается множество очень мелких файлов - скорость будет порядка 0,5мб/с -1мб/с

Примерно то же самое по записи.
Скорость которую вы видите в проводнике это усредненные значения, там еще и кэширование влияет.
В общем открывайте монитор ресурсов и смотрите загрузку дисков - какая очередь у диска.
Если очередь больше единицы - значит он просто не может читать быстрее.

HDD упал и появились битые сектора.

На помойку.

Как скрыть битые сектора?

А зачем? Хранить ценное на нем опасно, хранить данные для обработки - постоянные тормоза и глюки.
Так что выкинуть.
Скрыть битые сектора это переназначить, это сделает сам диск. Просто запустите полное форматирование.
Больше - ничего не сделаешь.

Вопрос - связано ли это как-то со скриптом, или же это просто стечение обстоятельств?

Не связано, стечение обстоятельств.

но странно, что он вот так, за секунду, сдох.

Ну чтобы сдохнуть требуется гораздо меньше времени чем секунда - просто раз и сдох, мгновенно.
А проблемы с диском вполне возможно были и до этого, вы просто их не замечали.

И как жесткий восстановить в домашних условиях?

Восстановить жесткий диск вообще невозможно, в любых условиях.
Прочитать информацию - вполне возможно, но требуются знания и специальное оборудование.
Если диск не определяется - в домашних условиях с ним ничего не сделаешь.

В операционной системе не виден. Виден только контроллер Intel MegaSR.

Ну разумеется он не виден.
Диски подключенные к контроллеру увидеть с ОС невозможно.

Как инициализировать SSD диск?

Что вы под этим подразумеваете?