Какой то хреновый у вас опыт.
В юнити нет и никогда небыло JavaScript. Там был UnityScript, синтаксически схожий с JS. Но уже нету.
Но в целом - непонятно на кой черт вам VPS для одновременной работы команды, который должен тянуть юнити. Каждый работает локально, сливает проделанную работу в git (например) (вот его можно и на VPS завести, если хочется свое решение), и все довольны.
Вы что, собираете в несколько лиц в одной сессии работать? Зачем? Никто так не делает.
Не уверен кстати, что бесплатный VPS на Win вообще возможен - как минимум вам лицензию винды надо оплатить. А еще нет никакой уверенности, что VPS и WinServer в принципе потянут юнити - как бы там нужно что то да рендерить, а для этого нужна какая-никакая, но видяха с DX/OpenGL.
