Евгений

Никак, это аппаратный уровень.

Не занимайтесь болью, сделайте нормально на js, пара строк на js заменит кучу строк с костылями на css

Серьезно? При чем тут javascript или ajax, у вас же ясно написано, что ошибка в PHP, даже указана строчка и в чем именно проблема:

Notice: Undefined index: data in D:\xampp\htdocs\index\form.php on line 28

Неизвестный индекс data в $_POST скорее всего

Никак, php не может держать соединение постоянно, если конечно же не поднимать вебдемона, но это того не стоит. Используйте лучше инструменты которые с этим лучше справляются например nodejs из самого доступного, потом можете общаться из nodejs приложения с php приложением.

Чем стандартый UglifyJsPlugin из коробки не подошел?
У меня такой конфиг - все работает прекрасно:

const { optimize } = require('webpack');
const { UglifyJsPlugin } = optimize;

new UglifyJsPlugin({
    beautify: false,
    comments: false,
    mangle: {
        screw_ie8: true,
        keep_fnames: true
    },
    compress: {
        screw_ie8: true,
        sequences: true,
        booleans: true,
        loops: true,
        unused: true,
        warnings: false,
        drop_console: true,
        unsafe: true
    }
})

debounce, throttle?

Как вариант вы можете задать css для блока в котором скролите:

if ($window.scrollTop() > scrollTopLimit) {
    $container.addClass('fixed');
}

.fixed {
    overflow-y: hidden;
}

Тут пара вариантов
Получаем нужный нам документ, обновляем - сохраняем
1:

const xo = await XO.findById(id);
xo.board.push(10);
await xo.save();

Используем $push
2:

await XO.update({ _id: id }, { $push: { board: 10 } })

Парсинг:
const parsedData = JSON.parse(responseFromAPI)
Если хотите расширить какие-то свойства, то:

const extendedData = Object.assign({}, parsedData, { /*custom props*/ });

Angular.js - клиентсайд, Java - серверсайд, напрямую из клиента нельзя обращаться к методам на сервере. Используйте REST интерфейс и будет вам счастье.

Возможно вы выбрали немного сложную архитектуру, раз у вас возникают такие проблемы. Пользуюсь реактом уже порядка полу года +-, очень удобно работается. Спустя какое-то время при правках никаких проблем не возникает, большая реиспользуемость опять же при правильном подходе.
По поводу вопроса, возможно вам стоит посмотреть в сторону mobx, где тоже реактивный подход. Кода там нужно писать на порядок меньше из-за большой абстракции, но опять же это влечет за собой сложность в понимании происходящего. В redux же все на чистых функциях, никакой магии, все компоненты\редьюсеры\экшены легко покрываются тестами.