У вас в постановке задачи значительный изъян: вы хотите научиться администрировать Линукс, но не знаете, как и для чего. А ответ именно в этой стороне.
Админить Линукс-сервер - это в значительной части сеть, сервера и службы. Для изучения этого в принципе нежелательна графическая оболочка, хороший вариант - Debian, поскольку по нему элементарно много материалов, в том числе вопросов-ответов-статей для неофитов.
Админить же линуксовые рабочие станции - это разбираться в разных DE, разборки с дровами и периферией в тех случаях, когда оно не заработало из коробки, настройки программ и проч. Здесь, конечно, нужно что-то популярное вроде Убунты (лучше деривативов, поскольку в оригинальной Убунте пользователя стараются не пускать под капот). Но практическая польза от занятий этим делом в виртуалке довольно сомнительна - проблемы-то возникают на реальном железе, в виртуалке все хорошо... Как минимум - нужно ставить ее себе основной системой без постоянного выпадания в винду.
