Сертификаты не нужны. Некоторым все же нужны, чтобы потрясать перед клиентами, но всерьез их никто не воспринимает (разумеется английский другое дело).
Портфолио могут и не спросить, да его может и не быть, если разрабатывал внутренние системы.
Требования у всех разные, кто-то требует умение самостоятельно разрабатывать несложные сервисы с применением фреймворков, а для кого-то достаточно базовых знаний и желания учиться.
Плюсом может быть умение работать в команде, умение писать тесты, знание git, базовые знания Linux. Для отдельных restful api.
Не все спрашивают, но важно понимание протокола http, на уровне типов запросов и их составляющих, web-сокеты пока с джунов вроде не требуют.
В больших городах предложения на любой вкус, но больше в соответствии с современными тенденциями (фреймворки, composer и т.п.). В маленьких много любителей велосипедостроения. В любом случае, есть из чего выбрать.
