Для того что бы качать файлы ИЗ гостевой системы, нужно подключатся непосредственно к ней, по сети например, а не к хостовой системе.
Для того что бы скачать файлы .vmdk САМОЙ гостевой системы, вы должны выключить гостевую систему, подключиться, например, vShpere клиентом к хосту ESXi и скачать файлы.
Но логичнее использовать какую нибудь систему резервного копирования типа Veeam Backup, она позволит на горячую, не выключая гостевую систему делать её резервные копии и получать доступ к файлам после этого.
Снапшоты не используйте в ручном режиме. Неправославно это.