Saboteur

Нагуглить отдельные линки можно самостоятельно, интересуясь конкретными девайсами. Общего стандарта нет, и учитывая, что область ИОТ и мелких устройств очень широка и не требует значительных финансов для разработки собственной платформы, это может быть что угодно.

Но в подавляющем большинстве это это С/С++ или основанный на нем язык с некоторыми изменениями, поскольку в первую очередь это вопрос платформы (операционной системы или прошивки) либо почти неизмененный с/с++, с набором библиотек и отдельным компилятором. Например robocraft.ru/blog/arduino/25.html - про ардуино
Поверх этой платформы могут быть более высокоуровневые решения, как например java для Андроид со своим набором библиотек и инфраструктурой.

Писать самую маленькую программу в мире не нужно (62 байта).

Что-то слишком много как для самой маленькой программы в мире. Есть же гораздо меньше.

К примеру, какой примерно размер билда может быть у утилиты, которая просто отслеживает двойной щелчок мыши во всех запущенных приложениях?
GUI - просто кнопка "reset" и счетчик нажатий, без красивого оформления, с упором на минимализм. По моим прикидкам даже 100Кб будет много, хотя тянуть с собой стандартную библиотеку не зазорно, но всё же слишком жирно для такой простой задачи.

Зависит от того, что за операционная система, и перехватывает ли приложение доступ к мышке. Вы считаете размер файла на диске, или сколько программа будет в памяти занимать, с учетом подгрузки динамических стандартных библиотек?

Подразумевается, что таких мелких программ может одновременно работать очень много. К примеру, 20 штук (под разные хотелки). И если каждая будет под 100 Мб, то это как-то не круто. Вспоминаются старые добрые времена, когда всем за глаза хватало 640Кб...

Так напишите одну программу с 20-ю хотелками и все.

В старые добрые времена 640 кб никому не хватало. Вдобавок в те времена, windows была совсем не многозадачной и не умела все то, что сейчас происходит. Даже банально работа с графикой - есть разница между 320x200x256 и 1920x1024x65536.

По языкам - не суть важно. На самом деле на каждом языке можно писать с умом и оптимизацией. Но для ваших задач - нет смысла сейчас выбирать специализацию. Ваши программы очень простые. Попробуйте написать их на c++, на C# и на java/kotlin и посмотрите потом, какой язык вам больше подходит. Не бросайте все три после первой же программы. Попробуйте все-таки развиваться некоторое время во всех трех. Так поймете больше разных концепций, и собственно почему инструмент выбирают под задачу.

ВКонтакте переписывался с PHP на C на сколько я знаю.

Кто вам мешает пойти таким же путем?
Когда ваш проект начнет тормозить, купите сервер помощнее.
Когда сервера помощнее не будет хватать - перепишете. Точнее наймете специалистов, которые перепишут.

А сейчас не забивайте себе голову. Преждевременная оптимизация - вредна.

Ваш вопрос звучит примерно так:

"На каком языке удобнее всего писать стихи"

Ответ: На любом.

Смотря для кого, смотря что вы знаете и умеете.

Начните с хобби-проекта.
Не рандомный однотипный сайт, а реальный хоббипроект, где вам важен конечный результат, которым кто-то пользуется.
Сайт или раздел для школы/института с каким-то полезным функционалом.
Простую игру или приложение для анализа.

Важно не направление, важно понять смысл задачи и реализовать ее каким-либо инструментом. Так научитесь использовать инструменты, а не просто "учить" их.

Простой пример:
Нужно автоматически копировать файл с одного компа на другой с определенной периодичностью.

Нужно ли для этого учить ftp/ ssh/ какой-нить googledisk? Не обязательно. У вас цель не ftp изучить, а настроить процесс копирования. Любым способом. Настроите - посмотрите как оно работает - и это уже будет выполнена реальная задача. А минусы конкретного инструмента по ходу можно будет увидеть на практике.

А зачем вам это? Синтаксис обычно изучается за пару дней.
Попробовать нужно не языки программирования, а технологии.
Поставьте себе задачу не хелловорлд, а чуть посложнее, напишите ее на разных языках, посмотрите где вас больше прет.
Или тупо ставьте себе задачу посерьезнее и пишите на разных языках разные части.

Говорят C# уже можно в Линукс, а раз хотите изучить, можете рискнуть.
А так - вопрос что за GUI.
Какая-нить утилита с простыми окнами, так можно и на js вебморду к ней сделать будет кроссплатформенно, а бэкенд уже на чем хотите с вариантом переписать его потом на другом языке.

P.S. Только не электрон.

JavaScript
bash
PL/SQL
Assembler

А что такое по-вашему инженер ИБ?

Писать инструкции безопасности для компаний? - вам на юридический.
Или вы хотите писать продукты для безопасности? - просто банально изучайте программирование.
Или вы хотите стать интегратором систем безопасности - вам на электронику.

Покопайтесь на текущем рынке вакансий, посмотрите требования тех вакансий, которые вам интересны.

Как вы себе представляете кроссплатформенность в администрировании виндовс и линукс, если у них совершенно другие внутренности? Автоматическая установка драйверов в виндовс и линукс - разные вещи.
Многие вещи в windows сети ставятся централизованно через global policy, о чем Линукс понятия не имеет.
Опять же, установка софта - он же разный.

В принципе,
Для Линукс конечно лучшее это bash
Для Windows - powershell/bat

Можно поставить git на windows, чтобы bash скрипты работали.
Но все равно, для ряда задач, нужно будет в скриптах делать условные переходы и вызывать либо sysinternals и powershell для windows, либо gnu/bash с sudo на линуксе.

Для банальных вещей - bash/python/perl должно быть более чем достаточно, но это не столько автоматизация администрирования, сколько общая автоматизация.

В php это можно сделать в одну строку

файл: test.php
<?php echo "<p>Welcome to PHP</p>"; ?>

Запустить  его 
php -S localhost:80 test.php

А вообще, вы путаете язык и готовую встроенную библиотеку для веб сервера.

Есть смежные языки, которые не пересекаются в плане конкурентности, а наоборот дополняют друг друга.
Например javascript/html/css/kotlin
Или например bash/c++ вообще никак не противоречат друг другу.

Любые можно применять.
Чаще всего в качестве ембеддед операционки используются варианты Линукса, на котором кроме родных c/c++ есть и питон и джаву можно поставить и js и bash и вообще все.

Редко когда используется что-то эзотерическое - чем дороже устройство, тем проще в него впихнуть нормальный проц с нормальной ОС и не париться с ограничениями.

На любом.
Вам нужно не столько язык программирования изучить, сколько работу ОС и технологии, чтобы понимать откуда брать нужную вам информацию и как отправлять уведомления.