Для начала нужно нести железо в сервис и материться, это не нормально, когда после сервиса вам отдают недоделанную работу.
Система восстановления windows работает так будто она сделана из хрусталя и находится в комнате полной слонов и бегемотов, а у вас в руках хлопушки. Т.е. чтобы оно перестало помогать достаточно сделать любой неосторожный шаг (мое мнение это неприемлемо для систем аварийного восстановления, которые должны быть чуть более устойчивы).
Для начала сделайте бакап критичных данных из ubuntu, я обычно делаю дополнительно копию c:\ProgramData и c:\Users, и может быть c:\windows\system32\config, чтобы была возможность восстановить настройки для приложений, если это критично, плюс там документы обычно хранятся.
Затем, если систему устанавливали не вы а она шла в поставке с железом, необходимо воспользоваться штатными инструментами сброса до заводских настроек, обычно это использует либо скрытый раздел либо внешний диск или usb, образ которого можно скачать с сайта производителя для конкретно вашей модели).
Если систему устанавливали вы (и сами решали проблему с лицензией) то переустановите ее и не майтесь дурью.
Успешных решений системных проблем на windows можно по пальцам пересчитать (это не значит что это не невозможно, но проще с нуля все переустановить чем искать какие системные файлы повредились, как их восстановить и т.п.)