Геннадий

Авторы надеялись, что к железу можно будет обращаться с помощью абстракций - производитель железа у себя реализует java-машину, а уж сверху нее можно запускать прикладной код.

Вы забываете о большом пласте истории техники, который был сильно до этого - 8 битные домашние ЭВМ (десятки их) и язык Бейсик.

Так вот, ЭВМ того времени были катастрофически разными - разные носители (кассеты, дискеты, картриджи), разная аппаратура (засунуть еще один центральный процессор в дисковод? да нивапрос! разная скорость для PAL и NTSC версий - легко!). Но вот бейсик был везде и позволял, с некоторыми переделками, таскать программы с машины на машину.

Таким образом, авторы находились в этом историческом контексте (у них все детство прошло в обнимку с каким-нибудь VIC-20). Тут уже становится логичным желание сотворить то же самое, только круче - берем современный язык, стандартизируем синтаксис - и делаем аналогично - производитель железа предоставляет нам Java-машину с нужным уровнем абстракции - и все программы бегают с архитектуры на архитектуру без переделок.

Отчасти, это сработало на старых мобилках, в эпоху j2me - это как раз Java, засунутая в телефон - игры, браузеры, карты (были даже ЯндексКарты), читалки, чатилки - куча всего.

Еще один виток эволюции, которые вы, видимо, не застали - (чорд, я - стар, я очень стар) - попытки сотворить интерактивные веб страницы.
"У нас же есть всюду переносимая Java - давайте влупим ее поддержку в браузер в виде апплетов - небольших приложений". Тут резко активировались вирусописатели и прочий сброд - благодаря развесистой и дырявой архитектуре, апплеты могли творить всякую дичь.

Сейчас апплет на java можно встретить во всяком старом железе, на нем там сделано GUI для удаленного администрирования серверов, коммутаторов и СХД. Вы браузером заходите на железку, и тут на вас вываливается ворох предупреждений о том, что сейчас будет запущено какое-то ужасное дырявое ПО, держите штаны, а то слетят. Уверены? Точно уверены? А с этим согласны? А так?

А уже потом начали активно применять JavaScript, главным образом, изобретя Ajax - продолжая люто натягивать сову (систему для создания электронных библиотек для ученых/HTML) на глобус (задачу создания интерактивного гуя с красивой версткой).

И это вы еще бэк на Perle не рефакторили

Вариант с экранированием:

<?php echo do_shortcode( '[gridmaster grid_style="style-2" post_type="game" posts_per_page="10" orderby="date" order="DESC" content_from="excerpt" excerpt_type="characters" excerpt_length="15" show_read_more="yes" read_more_text="Скачать" grid_image_size="medium" grid_image_width="350" grid_image_height="200" link_thumbnail="no" link_thumbnail_to="post" show_filter="yes" filter_style="default" btn_all="no" taxonomy="category" hide_empty="1" multiple_select="no" toggle_filter_items="no" pagination_type="load_more" infinite_scroll="true" animation="true" heading_font_size=\'{"xs":"16px","sm":"18px","md":"20px","lg":"22px","xl":"24px"}\' grid_col_gap=\'{"xs":"30","sm":"30","md":"30","lg":"30","xl":"30"}\' grid_row_gap=\'{"xs":"30","sm":"30","md":"30","lg":"30","xl":"30"}\' grid_item_per_row=\'{"xs":"1","sm":"2","md":"3","lg":"3","xl":"3"}\' slider_args=\'{"arrows":"1","autoplaySpeed":"3000","infinite":"1","slidesToShow":{"xs":"1","sm":"2","md":"3","lg":"3","xl":"3"},"slidesToScroll":{"xs":"1","sm":"1","md":"1","lg":"1","xl":"1"}}\']' ); ?>

Вариант с NOWDOC синтаксисом, как подсказал Ivan Ustûžanin:

<?php echo do_shortcode( '[gridmaster grid_style="style-2" post_type="game" posts_per_page="10" orderby="date" order="DESC" content_from="excerpt" excerpt_type="characters" excerpt_length="15" show_read_more="yes" read_more_text="Скачать" grid_image_size="medium" grid_image_width="350" grid_image_height="200" link_thumbnail="no" link_thumbnail_to="post" show_filter="yes" filter_style="default" btn_all="no" taxonomy="category" hide_empty="1" multiple_select="no" toggle_filter_items="no" pagination_type="load_more" infinite_scroll="true" animation="true" heading_font_size=\'{"xs":"16px","sm":"18px","md":"20px","lg":"22px","xl":"24px"}\' grid_col_gap=\'{"xs":"30","sm":"30","md":"30","lg":"30","xl":"30"}\' grid_row_gap=\'{"xs":"30","sm":"30","md":"30","lg":"30","xl":"30"}\' grid_item_per_row=\'{"xs":"1","sm":"2","md":"3","lg":"3","xl":"3"}\' slider_args=\'{"arrows":"1","autoplaySpeed":"3000","infinite":"1","slidesToShow":{"xs":"1","sm":"2","md":"3","lg":"3","xl":"3"},"slidesToScroll":{"xs":"1","sm":"1","md":"1","lg":"1","xl":"1"}}\']' ); ?>

Если использовать нормальную IDE, то она сообщит о возможных проблемах:

Посоветуйте, как можно было бы максимально безболезненно восполнить утраченные знания, а также наверстать упущенные новшества в языке?

так это...

Сейчас хочу попробовать реализовать научный проект.

Собсно практика - лучший учитель, садитесь и пишите. Если базу уже знаете реализация не станет проблемой. По ходу решения текущих задач проекта познакомитесь со всеми нужными изменениями и практиками, сегодня на любой чих есть дока, туториал, видео и чатжпт. Двух зайцев двумя плюсами, так сказать...

А Вы права вебсерверу дали на папку и файлы ?
это который пользователь www-data

Это часть традиционной архитектуры системы. Файлы шаблона стоит хранить вместе, чтобы потом, когда вы станете настраивать сканирование и индексацию сайта, вам не пришлось мучиться с настройками доступов. Да и поддерживать проект будет сильно проще.

Скорее больше для группировки файлов CSS, JS, images, fonts.
Никакой критичной функциональности данная папка - не несет.

Если заглянуть в репозиторий WP themes, то там видно, что файлы в старых версиях разбросаны по корневой директории темы, а потом группируются в assets

document.addEventListener('DOMContentLoaded', () => {
    // ...
}, {once: true});

Меню (три точки) → Настройки → Персонализация → Расположение адресной строки → Снизу.

https://www.php.net/manual/ru/function.min.php

1) Получать с сервера ссылку, а не подставляя ее в js.
2) Записывать куда то определенный hash на открытие страницы
https://мойсайт.ru/страница-благодарности.php?hash=123 и потом гасить его, чтобы человек не мог повторно открыть страницу.

Возможно просто рендер страницы благодарности вместо формы отрисовать после события успешной отправки формы.

Добавьте pointer-events: none; в класс картинки.

Регулярное выражение должно быть обёрнуто символом-разделителем. У вас первый символ - слэш, он и считается разделителем, но быть разделителем не может.

-"\[cp_theme:([_a-zA-Z0-9\]*)\]"
+"~\[cp_theme:([_a-zA-Z0-9]*)\]~"

Быстрее было бы найти ответ в поисковике, чем оформлять вопрос здесь.

Вероятно стили подключаются относительным путём

<link href="style.css">

А следует использовать абсолютный

<link href="/style.css">