Система была разбита на 800 Гб под винду, и 200 Гб под линукс.
Как влияет частая переустановка ОС, изменение тип файловой системы (например с NTFS на EXT4), использование 2 ОС с разными типами файловых систем и тд.
P.S. ещё, что я заметил, то при загрузке операционной системы, жесткий диск непривычно активно и громко работает при загрузке линукс.