ThunderCat

сделать джоин субъектов и выбирать по вэа субжект.ид=субжектид или квесчн.ид_субжект=субжектид

А можно подробнее?

Можно, но разбор такого кода займет много времени,
1)

SELECT COUNT(DISTINCT question_text) FROM questions

Абсолютно бесполезный дистинкт, так как у вас все записи уникальные (в теории), или отличаются вариантами ответов и тогда это разные записи, то есть ОЧЕНЬ ДОРОГАЯ операция у вас там просто прелеплена нашару.
2) для ВСЕХ операций с бд предпочтительнее использовать int поля нежели текстовые.
3)

мне необходимо, чтобы данные соответствовали выбранному варианту (subject_title и subject_name),

На самом деле нужно чтобы совпадал subjects.id (он потому и уникальный идентификатор!), который и надо передавать для выборки, а не какой-то subject_title или subject_name.
4) в запрос для этого соответственно нужно добавить джоин субжектс, выбрать нужный subjects.id, который передали по клику, и тогда разделять ничего не придется, в выборке будут только поля, относящиеся к нужному субжекту.

Вариантов 2.
1) Подгрузить все вопросы в json и выбирать их по мере прохождения, подгружая в одну форму нужные поля. Подходит для "честных" пользователей, то есть тех, кто проходит тест для проверки собственных знаний, а не для "получить оценку по предмету".
2) Скрипт возвращает готовую хтмл разметку всего вопроса, которая затем либо вставляется в форму, либо уже с формой приходит и заменяет текущую.

В обоих случаях у вас не нужна никакая функция send(), достаточно повесить на документ слушатель субмита формы, и уже в нем отправлять аякс запрос со всеми данными текущей формы. И не надо никаких подстановок.

Нет времени на установку скриптов, или что то не получается? Мы установим, и настроим все за тебя, за дополнительную плату. Писать Вконтакте по ССЫЛКЕ. Посмотреть отзывы можно по ссылке.
Услугу предоставляет Администрация сайта VipAdmin.Club

Там же все четко написано, че вы тупите то...

это называется EAV

нужно при клике на чексбокс ajax-ом получить/фильтровать товар, который выводи этот файл Product.php

1) Чекбоксы что у вас фильтруют?
2) В Product.php нет функционала, учитывающего более одного параметра, и то - только категорию.

не понимаю как в обработчике ajax запроса, взять эти данные

Плохо, значит пока еще слабо знаете свою предметную область. внизу вашего вопроса есть пример, эти данные там есть, что с ними делать зависит от того что нужно получить.

надо ли обращаться к этому файлу Product.php

В представленном виде он бесполезен для вашей задачи, нужно писать метод получения списка из произвольных параметров. Потом сформировать из списка хтмл с готовыми блоками и отдать его (сделать echo) обратно. Только в аяксе надо будет заменить dataType: 'html'

1. Делают ли так?

Делают, но это не хорошая практика. Во первых имеете шанс затереть какие-то настроечные данные объекта и получить непредсказуемость поведения. Во вторых, если у вас там значения из бд или другого хранилища в формате ключ-значение, лучше хранить их в отдельном поле, том же дата, но в виде stdClass, чтобы не путать их при работе с хранилищем с остальными полями, например так:

public function setData(array $data):void{
  $this->data = (object)$data;
}

в идеале у вас должен быть DTO (data transfer object), но в актив рекорд движках он обычно не используется.

для апача называется mod_rewrite, для нжинкса используется другая директива (лень искать, гугли).

на сервере site.ru/cp/admin.php, чтобы в браузере на самом деле отображалось site.ru/cp/panel (грубый пример).

Для этого еще нужно обрабатывать скриптом, или писать отдельные правила серверу на каждый чих. То есть либо единая точка входа и роутер, либо жесткие правила в конфиге сервера.