Sanes

У вас есть или должна быть таблица счет/заказ, там и храните все расчеты для истории.
В товаре не должно быть никаких курсов или скидок. Только товар и базовая цена.

Modx плохо подходит для подобных задач. Ничего кроме Tickets на эту тему нет.

На Битриксе уже все интеграции готовы. Не надо изобретать велосипед.

Если он вам не нужен, то и не забивайте голову. В свободное время, если интересно можете поковыряться.

На Laravel есть готовые админки.

HyperV, Virtualbox, VMware Player

Нормальный домен стоит 69₽. В зоне .net.ru/.pp.ru

Хлебные крошки нужны для навигации. Текущей странице там делать нечего.

Обычный PHP это умеет.

Что там уметь? Наливай, да пей!

1. Прикидываешь функционал
   
2. Подбираешь дополнения
   
3. В документации все примеры есть
   

Всем серверам, куда нужен доступ подключиться к VPN?

Так же как обычный магазин. Только к товару добавляется сущность продавец.

Свой почтовый сервер содержать дорого. Чтобы работало хотя бы на уровне 'Хорошо".

Fastpanel на сегодня самая вменяемая из бесплатных. Работайте с ней.

в ISP поддомены вроде за сайт не считаются, так что меньше

Считаются www-домены, т.е. виртуальные хосты. Не важно, какой уровень у домена.

Wordpress

Свистелки уберите.

Debian, Ubuntu, Centos (rocky, alma) . Остальное не серьёзно. Это чтобы ты научился настраивать окружение. Ставить это надо на виртуальную машуну в win10

Любая ставится. Но доделывать придется.
И это будет дольше, чем сделать бекап и восстановить на нормально настроенном сервере.

PhpMyAdmin можно просто запустить из директории сайта. Это никак к панелям управления не относится.