AD и Radius сервер? - можно, но не рекомендуется
AD и AD Federation Services? - можно. Если поднимается ADFS ферма - то лучше отдельно
Можно ли FS и CA держать на одном сервере? - можно, но не рекомендуется. CA - критичный сервис, лучше держать отдельно
Можно ил FS держать там же где и IIS? - можно, но не рекомендуется
Или CA и RDP-сервер? - можно, но не рекомендуется. CA - критичный сервис, лучше держать отдельно. RDS тоже лучше держать отдельно от других сервисов
AD, DHCP+DNS или DHCP с DNS вообще лучше на маршрутизаторах держать? - все можно держать на DC, DNS интегрировать в AD