MonoStas

Я бы не стал так все в одну кучу валить.
pug — это не только шаблонизатор, но и препроцессор, то есть он предоставляет альтернативный, во многом удобный синтаксис.
Для vue/react генерация html это только часть обязанностей, они еще должны аккуратно и быстро обновлять его и реагировать на пользовательский ввод.
Если проект не предусматривает динамического фронтенда, то вполне можно обойтись одним шаблонизатором — pug/handlebars/что хотите. Далеко не везде нужен SSR.

P.S. то, что react нельзя использовать с pug — это личные половые трудности сугубо реакта. Я использую vue+pug и доволен как слон:)

Фикстуры - это по сути тестовые данные. Они нужны для unit-тестирования. Это могут быть как данные в базе, так и обычные файлы (обычно 2 варианта, до и после обработки так скажем). Каждый раз когда запускаются тесты, эти данные используются для установления начального состояния системы, что бы тесты всегда выполнялись предсказуемо.

Для функционального тестирования (тестрирование контроллеров, интаграционных тестов) фикстуры не применяются, хотя суть там так же сходна. Если честно, то тут мнение расходится. Одни говорят что при функциональных тестах нельзя использовать даже моки, то есть система в процессе выполнения тестов полностью создает то состояние которое необходимо для других тестов. Например последовательное выполнение тестов на добавление статьи и ее просмотр. Другие же предпочитают для каждого тесткейса выставлять состояние с нуля. По сути это схоже с использованием фикстур, но реализация различается. У вас есть некое api для заполнения данными (скажем метод добавляющий пользователя), и перед выполнением тест-кейса происходит ресет данных и заполнение их новыми. Плюсы так же есть - можно распаралелить выполнение тестов. (но не верьте мне на слово)

Миграции - механизм организации версионности структуры проекта. Вы можете написать миграцию для изменения местоположения статики (картинки, поменять ссылки в базе и т.д.), или же у вас добавляется новая таблица/поле. Обычно дополняется обратной миграцией, которая восстанавливает исходную структуру. Обязательно для работы в команде или при частом изменении организации данных в проекте, вообще я бы посоветовал использовать их всегда.

Да, конечно.

А почему должно работать? Вы воткнули мидлварь сессий после роутов. Мидлвари выполняются в том порядке, в котором их подключили.

Apache -> Nginx
Статика -> CDN + оптимизации (gzip, вырезание мусора из файлов, объединение JS/CSS), оба умеет CloudFlare (кроме объединения файлов по-моему), уменьшить файлы изображений можете с помощью optipng/jpegoptim

Ещё посмотреть что Google посоветует тут: developers.google.com/speed/pagespeed/insights