АртемЪ

Можно ли установить во внешний жесткий диск операционную систему?

Можно, но сложно.

Но надо понимать что работать будет заметно медленней чем по SATA.

Где узкое место в конфигурации компьютера для чтения множества фалов?

Основные причины-
1)Жесткий диск и интерфейс.
3)ФС
4)Собственно программа копирования

Есть программы, которые работают с чтением этих папок

Если под чтением вы понимаете отображение содержимого папки на экране - дело скорее всего в программе которая читает.

Вероятно начались проблемы с одной из планок.
Прогоните memtest для каждой из планок по отдельности.

Даже по указанной вами тематике задачи сильно различаются.
Как правило если вам нужен максимально быстрый - лучше брать десктопный процессор с максимальной частотой.
Если вам нужен максимально производительный, стоит смотреть в сторону серверных платформ чтобы было побольше ядер, частота уже не так важна.
Опять же стоит учитывать хорошо ли распаралеливается ваша задача.

Поскольку задача не новая, и вы ее регулярно выполняете есть смысл включить счетчики производительности и понаблюдать за нагрузкой - во что упирается.

1)Будет ли аккумулятор заряжаться?

Зависит от контроллера в аккумуляторе.

Если будет, то можно ли в это время включать ноутбук?

Без аккумулятора, от сети - можно.

Если аккумулятор не будет заряжаться, то будет ли при такой схеме запускаться ноутбук?

Зависит от ноутбука, как правило без проблем работает от сети.

IP KVM или IPMI

Если внешний жесткий диск подключить через этот адаптер, будет ли он работать?

Не знаю что за адаптер - как правило да, если питания хватит.
Обычно ноутбучному диску 2.5дюйма вполне хватает.

Не будет ли проблем, если я периодически отключаю\подключаю ноутбук к этому адаптеру (ну и зарядке, соответственно)?

Нет. Каких то особых проблем для диска нет.

Получается внешний диск будет постоянно стартовать и останавливаться или он будет постоянно работать?

Если питание будет отключатся естественно будет останавливаться как же он без питания.
А пока не отключите питание он будет вращаться, при длительном бездействии разве что головки запаркует.

Все зависит от объема - если вам хватит флешки, можно обойтись и ей, Если нужен большой объем - внешний SSD.

Если флешка - интерфейс USB3 и сама флешка должна быть высокоскоростной, с хорошим контроллером.
Я бы порекомендовал бокс вроде такого под M.2 и SATA M.2 SSD. Это будет дешевле чем флешка большого объема, и надежнее.
В общем компактно, быстро, приличный объем, и адекватная цена.

Встанет ли 64 битный windows?

Да.

Что будет, если поставить озу с большей частотой, например 1333 мГц, или 1600 мГц?

Обе планки будут работать на одной частоте, частота снизится до той, которую поддерживают обе планки.
Посмотрите есть ли свободные слоты куда эту память можно воткнуть, а то она бывает распаяна.

завтра ехать покупать либо ссд+озу, либо только ссд.

Покупать надо и то и другое. Чем то одним проблему не решишь.

Оперативки мало.
Надо не менее 8Гб.
Процессор нормальный.
Видеокарта не нужна для этих целей.
Диск под системой обязательно - SSD.

В общем либо добавляете оперативки до минимально допустимых 8гб и ставите SSD, либо меняете целиком на новый, где уже есть много оперативки и SSD.

Где купить компьютер с российским процессором и операционной системой?

У производителя, или продавцов.

Где можно нажать кнопочку "Добавить в корзину", потом "Оплатить", и спокойно ждать доставки?

Нигде. Такое только в рознице бывает. Экскаваторы, бульдозеры, атомные реакторы и прочую промышленную технику так не покупают.

Существуют такие инет-магазины? Без всяких уклончивых "цена предоставляется по запросу и только организациям и бла-бла-бла".

Такие магазины существуют для розничных товаров - которые продаются массово конечному потребителю. А вы интересуетесь явно не ширпотребом.

Ах да, компьютеры стоимостью как крымский мост не интересуют.

Цена компьютера обратно пропорционально его тиражу. Если их выпускают миллиардами - один компьютер будет стоить 10долларов. А если выпустить тиражом десять экземпляров - то цена будет сотни миллионов долларов.
Поскольку процессоры выпускают ограниченным тиражом - ценник довольно высокий. 50-70тыс. рублей за процессор минимум. Системник дешевле 200тыс рублей не купите.

Гуглите стандарты нужной вам платы - например ATX, miniATX, miniITX - там есть все размеры.

1. Зависит от ПО далеко не все нормально работает в терминале - про фотошоп и автокад например можно забыть.
   
2. Вас ждет зоопарк на сервере терминалов. Если собрались делать сервер терминалов не устраивайте там зоопарк. 1с, ворд, эксель и никаких там автокадов и тем более специфических ПО для тестирования.
   
3. Конечно.
   
4. Если у вас меньше 50 пользователей, то в сеть явно не упрется.
   

corei3?, недорогую мат.плату, и планку памяти на 8Гб.

Искал в Украние

Смешно. Вы бы еще в США поискали.
Все заводы в Китае.

Где искать такие компании, куда лучше обращаться?

На алибабе естественно. Они все там. Там же и обращаться. Это если что-то простое и несложное. А так лучше представителя в Китае завести, и его озадачить.

1)Подходящий под цвет серверной.
2)Не обязательно, можно под каждую задачу взять сервер за 300000
3)Под цвет серверной.