Если биос позволяет загружать, то конечно можно.
Если внешний диск будете подключать через USB 3.0, то можно SSD взять. А так спорно, что на много лучше будет, хотя обращение к мелким файлам будет летать, по сравнению HDD.
И не проще ли на флешку записать live CD и запускать где угодно?
Тут конечно все от задачи зависит.