реестр это же память всех установленных и когда-либо использованных программ, которые ОС проверяет перед загрузкой при включении ПК
Реестр это база данных, просто база данных.
там хранятся данне в формате ключ-значение. по нынешним меркам это очень маленькая и простая БД чтобы сколько-нибудь влиять на производительность ОС.
Замедление работы обычно комплексная проблема вызванная некорректной работой как сторонних программ так и самой ОС которая с течением больших промежутков времени и с накоплением обновлений генерирует не совсем оптимальные настройки для своей работы (яркий пример, ооочень медленная работа WinUpdate в XP)... и по этому иногда помогает "чистка реестра" (фактически сброс устаревших параметров которые проложают влиять на функционал) которая сбрасывает исторически накопившиеся неоптимальные настройки на относительно актуальные