Года так 2 назад тоже пробовал прикинуть все это дело под RDS-ферму - все фигня.
Самый большой минус RDS (если сравнивать с VDI) - нет управления ресурсами: все - всем. И все страдают.
Создание RDS-фермы немного улучшает картину т.к. разным групам юзеров можно давать разные хосты/ресурсы для использования.
У меня есть пару RDS-ферм от 4 до 16 хостов в каждой и везде ЦПУ в рабочее время забит на 90+ процентов и его может "выжрать" как 2 юзера открыв по 100500 вкладок хрома так и 20 бух-в с их 1С и екселем -- просто "комфорт" работы в таких случаях разный.
Опытным путем я пришел к выводу что на 1 хост оптимально держать +- 15 юзеров (в моей, практический стадартной "нагрузке" касательно софта).
Так что если покупаете новый сервер - поднимайте RDS-ферму (мануалов много) - так и отказоустойчивость повысить получиться и ресурсами можна будет хоть как-то рулить. Профили юзеров в таком случае лучше держать на UPD.
ЦПУ берите с частотой повыше, если будет 1Ска.
Дисковая подсистема - ССД однозначно!