1. Все — дело привычки. Мне, например, Gnome сразу не понравился, а KDE более-менее нравилось, пока четверокеды не появились. Сам работаю теперь в IceWM. Основные отличия всех WM/DE — в количестве свистоперделок и гибкости.
2. Так делать не нужно. man hier
3. Есть всякие KDE'шные программки похожего типа. Кстати, если вам офис нужен не только для написания plain text'ов и всяких служебок, советую латех освоить.
4.
— MediaPlayerClassic == mplayer (mplayer, кстати, намного лучше)
— liferea, akregator…
— насчет торрент-клиентов не скажу: нет у меня их (сижу за прокси)
— простенький аудио-плеер == audacious, mpd, …
— Notepad++ == geany
— для работы со слоями PSD подходит только Gimp? не уверен. Аналог Иллюстратора существует? нет.
ник.
Буду благодарен также, если посоветуете любые полезные и интересные на Ваш взгляд программы для Linux.
Сложно что-то советовать, если непонятно, что именно вас интересует.