Для начала нужно узнать установлены ли иксы на сервере. Если установлены, то можно их пробросить в ssh как подсказал
devalone
Если нужен полноценный рабочий стол и плюшки, ставите ещё и графическую оболочку, типа xfce или lxde, в общем что полегче. Потом берёте X2Go server (установить на сервере соответственно) и у себя X2Go Client. Подключаетесь, работаете.