Как сама мышка может знать, каким образом что-то там считать с компа? Это комп ХОСТ, а мышка (или любое составное устройство usb) не может сама ничего делать, она может только определиться как одно или сразу несколько устройств usb. А вот дальше может быть сценарий BadUSB, когда мышка может быть и клавиатурой сразу, которая, например, выполнит после подключения нажатия на какие-то клавиши, и вполне может запустить на компьютере что-то нехорошее.
У меня вот мышка тоже представляется как составное устройство, клава+мышь. Но в 90% случаев это из-за кривой реализации доп.кнопок, которые обрабатываются виртуальной мультимедиа клавиатурой. У меня эту мышку касперский определяет как badusb, и выдаёт картинку с требованием ввести с этой виртуальной клавы код с картинки. На деле же, никаких комбинаций и нажатий она не нажимает, я это отслеживал, и спокойно много лет дома под линуксом работает и есть не просит.
Другой сценарий - это когда в ОС есть уязвимости, и на флешке в мышке (если есть такая) лежит что-то, чем можно эту уязвимость эксплуатировать. Например, классический автозапуск, и в нём прописан запуск какой-нибудь последовательности команд. Например, скачать какой-то файл и выполнить его. Для этого не нужны даже какие-то внешние программы, можно обойтись встроенными, например ftp, curl, и т.п. Дыры с эксплуатацией автозапуска были и в виндах, и в линуксах под КДЕ и другими оболочками (но под линуксами пользователь ещё должен был сам щёлкнуть по значку, и то, под пользователем что-то запустилось бы).
Защититься - под виндами можно использовать тот же каспер, он умеет это (kes с 8 вроде версии умеет). Или в реестре отключить параметр, который позволяет пользоваться usb накопителями (usbstore). При надобности - включить вручную. Дело простое - создать два рег-файла, и одним выключать, другим включать, если понадобилась флешка вдруг. От виртуальной клавиатуры в мышке..... не знаю как просто без сторонних инструментов защититься.
Под линуксами - можно как-то в udev прописать правила, в котором запретить работать определённому устройству, или даже классу устройств. Подробности гуглить, так с ходу не скажу.
Но правильное решение - не тыкать в свой комп что попало! Купил мышку, проверил - работает как надо - пусть работает. Если определяется как составное устройство - купить другую, если совсем паранойя, ну или тоже протестить и если всё ок, пусть работает.