Самые быстрые виртуальные машины у javascript (nodejs) и как ни странно у php, если речь идет о самом языке программирования а не о подключаемых библиотеках, которые могут быть реализованы нативно а значит так быстро как это в принципе возможно.
Быстрее только LLVM, это целая инфраструктура, не только компилятор (там даже к языку программирования привязки нет), тяжела для встраивания в свой софт но зато результат будет максимально производительный.
Кто то вспомнит java и его байткод, тоже вариант, тогда сюда для кучи .net виртуальную машину, только они не такие производительные как выше указал.
python - самая медленная виртуальная машина (правда есть решения по ее ускорению) зато самая крутая поддержка сообществом и библиотеками. Но использовать ее как встраиваемую - сложно, особенно если важна защита от выхода из песочницы.