Интересный вопрос — если выводить через payoneer, то есть мимо рассчетного счета, и, получается, мимо налоговой — можно ли как-то добровольно пойти в налоговую и сказать, вот, мол, получил $1000, хочу заплатить налог сам. :-)
Но я подобный договор (правда, я — ООО, не ИП) делал. Обычный договор с заказчиком, причем в банк его приносил, чтобы они посмотрели и одобрили (они не по каждому могут платежи проводить, важно чтобы договор им нравился), а в договоре указали, что платеж по контракту может приходить от компании Elance с такими-то реквизитами. После получения первого платежа с еланса на счет ООО вписали елансовские платежные реквизиты в договор задним числом, и по бумагам все получилось как надо.
