Такое впечатление, что Вас пытаются наипать. Работодатель может потребовать только возмещение расходов на обучение (ТК РФ, ст. 249). Более того, "...Договор, содержащий положения, противоречащие закону (императивным нормам), в этой части считается ничтожным (недействительным) и не порождает правовых последствий с момента заключения..."
Но все упирается в конкретный договор, а также в юридическую прошаренность работодателя и готовность судиться, еслиф че.