MongoDB я бы исключил, это из другой оперы.
Насчет MySQL\MariaDB\ Percona\AWS Aurora и т.д. - вопрос интересный. Во-первых, интересует ли нас что-то, кроме core продукта - вещи типа кластера, коммерческие плагины и т.п.
Интересуют ли нас нестандартные storage engine?
Нужен ли нам бизнес support?
На базе этого можно проанализировать и выбрать.
Другой вариант - просто использовать то что получили с дистрибутивом.