У вас нормали развернуты не в ту сторону у некоторых поверхностей.
Игровые движки для оптимизации не рисуют те полигоны, которые направлены не в камеру, а от нее.
В Блендере 2.8 можно поставить галочку face orientation, чтобы увидеть направление поликов.
После этого синим будут показаны полигоны, которые смотрят в камеру, а красным, которые смотрят от камеры. В игровом движке красные показываться не будут.
Я для примера развернул одну грань кубика, вот как это выглядит.