Алексей Черемисин

Для начала. Вообще-то Вы сравниваете компилированный код c# и интерпретируемый php. Я бы последний заменил на яву или скалу или го. Думаю, что результаты будут сравнимыми.
Во вторых, как правильно заметили - стоимость решения, на майкрософте в три раза выше, плюс более сложная настройка, обслуживание и привязка к вендору.
Для развертывания сервера под nginx достаточно практически любого vps-провайдера, для виндовс это опять в 3 раза дороже.
Ну а так, ничем IIS не хуже или лучше других. Я вот, например, вообще под виндовс не программирую (лет 12 уже), везде линукс и макос, и дома и на работе, да и мейнстримом я микрософт не считаю.

Может быть проблема в хосте, на котором виртуалки крутятся? Случайно это не виндовс?

Поставить как минимум ssh командой sudo apt-get install ssh
Получите возможность удаленно заходить на комп по ssh, копировать файлы туда-сюда.
Если нужно не только удаленную консоль, а например графику или доступ к файлам по сети, то установить vnc и samba, ну и настроить :-)

Первое, чтобы проверить, какие карты проинициализировались в ядре, нужно дать команду "arecord -l", будет примерно так:

root@xxx:~# arecord -l
**** List of CAPTURE Hardware Devices ****
Home directory /home/xxx not ours.
card 0: PCH [HDA Intel PCH], device 0: ALC892 Analog [ALC892 Analog]
  Subdevices: 1/1
  Subdevice #0: subdevice #0
card 0: PCH [HDA Intel PCH], device 2: ALC892 Analog [ALC892 Analog]
  Subdevices: 1/1
  Subdevice #0: subdevice #0
card 1: S0000 [SC580, Audio Capture #00.00], device 0: PCM #00 [PCM #00]
  Subdevices: 1/1
  Subdevice #0: subdevice #0
card 2: S0100 [SC580, Audio Capture #01.00], device 0: PCM #01 [PCM #01]
  Subdevices: 1/1
  Subdevice #0: subdevice #0
card 3: S0200 [SC580, Audio Capture #02.00], device 0: PCM #02 [PCM #02]
  Subdevices: 1/1
  Subdevice #0: subdevice #0
card 4: S0300 [SC580, Audio Capture #03.00], device 0: PCM #03 [PCM #03]
  Subdevices: 1/1
  Subdevice #0: subdevice #0
root@xxx:~#

Второе - посмотреть в биосе, может быть просто карта запрещена.
Третье - запустить alsamixer и подвигать ползунки.
Четвертое - если стоит графика, то посмотреть на pulseaudio, права доступа в audio-устройствам и прочее.

Если нет устройств по arecord, то смотреть в сторону драйверов...
Если устройства находятся, то как минимум они работают, но звук может просто не туда маршрутизироваться аудио-демоном, обычно это pulseaudio, но бывает и jack-audio и oss!

Ну и проверить, что просто звук идет через нужную карточку:
# cat /dev/urandom | aplay -D hw:0,0

Ну и вот ссылка на всякий - en.wikibooks.org/wiki/Configuring_Sound_on_Linux/H...

Посмотрите на graphite.wikidot.com
Тут и база данных и простой API для добавления, и веб-интерфейс и куча разных агрегатных функций и масштабируемый и используется в куче подобных систем и приложений, и графики строит, причем по любым значениям, и данные можно вводить скопом и за любой интервал времени. Достаточно прост в установке и освоении. Можно использовать как в малых инсталляциях для мониторинга десятков значений, так и например в яндексе пользуют для сбора параметров с десятков тысяч объектов.

Inotify в помощь ru.wikipedia.org/wiki/Inotify
И rus-linux.net/MyLDP/kernel/Inotify-tools.html

Ничего проще и лучше, чем FEC (Reed-Solomon) мир еще не придумал. Используется и в RAID-ах и в потоках DVB (со спутника) и везде, где нужно данные восстановить (tar FEC не использует, но можно его выход через FEC прогнать). Ну и утилитка rsbep в помощь. Только она наоборот добавляет избыточность в файл X, а не создает контрольный файл Y.

Наверное ext4, как самый мейнстрим, с которым работают около 80% пользователей. На втором месте наверное xfs, далее все остальное. Для восстановления, в случае чего, я бы выбрал vfat, так как прочитать его, в случае чего можно где угодно, а данные хранил бы в tar-формате, который плюет на испорченные куски своего архива.

Собрав все мысли вместе: VFAT + tar.

Для запуска top, нужно использовать псевдо/или/терминал (/dev/(p)tty), иначе библиотека termcap не сможет на нем работать. Как запустить процесс в php с использованием псевдотерминала - не знаю.
Или установить sar (sysstat) и использовать утилиту mpstat.

Так, если я правильно понял, то нужно шифровать не текущие логи (что немного нонсенс!), а только при архивировании (ротации)? Так просто нужно добавить команду по шифрации в logrotate конфигурацию (или что у вас за ротацию логов отвечает).

Не самое простое решение- collectd + graphite (в основном проблема в настройке связки и в настройке графита). Да, collectd практически ничего не жрет и почти не требует настроек. Ну а на графите любой график из данных коллекта в любых вариациях! Если graphite не осилите, то можно просто на collectd все сделать, у него даже простая мордочка есть, и ставится за 5 минут.

Вообще-то для этих целей есть rsync, который синхронизирует ипересылает файлы и каталоги. Синхронизируются только изменения, а не все файлы. ru.wikipedia.org/wiki/Rsync
Ну также есть механизм inotify для слежения за файлами en.wikipedia.org/wiki/Inotify

Да, можно. Скорее всего винда уже стоит. Нужно уменьшить размер партиции через утилиту администрирования диска в винде. Затем устанавливать линукс на свободное место.

В системе есть абсолютно все возможности по работе с крипто, начиная от организации крипто-туннелей IPsec, туннелей ssl/tls, крипто-дисков, крипто-контейнеров и заканчивая библиотеками криптографии типа openssl. Не всегда все это специфицировано в единый API, как в java или microsoft, но от этого не хуже работающее. Просто есть все это в нескольких реализациях, и иногда достаточно сложно выбрать чем пользоваться.
Обычно как стандарт для крипто-API используется openssl.

Collectd и graphite , один снимает, второй графики строит по всякому

www.netup.ru/UTM5/billing.php в помощь.